メソッドの SIM イオンをオーバーライドするには（メソッドのパラメータよりシーケンスでの設定を優先させるには）シーケンステーブルでターゲット質量を指定します。［SQ:SIM 質量］列にオーバーライドする SIM イオンを入力します。
オーバーライドする SIM イオンの指定と、質量がどのように変更されるかには、一連のルールがあります。「xxx;xxx;xxx」のようなパターンを使用して、シーケンステーブルに質量の値を入力します。ここで、「xxx」は質量です。これらの入力は、まず、ルールに従って検証されます。検証に合格すると、質量オーバーライドが SIM イオンに適用されます。
まず、オリジナルメソッドの SIM イオンは、極性によって分類されます。次に、ゲイン値に基づいて並べ替えられます。
オーバーライド質量の極性は、正の数（＋、ポジティブ極性）、または負の数（-、ネガティブ極性）で示されます。
オーバーライドする質量は、セミコロン（;）で区切ります。
質量オーバーライドの SIM 質量を入力するときに、極性を混在して指定することもできます（例："101; - 201; 301"）。ただし、これらは、オリジナルメソッドの SIM イオンの極性と一致している必要があります。
同じ極性のそれぞれのゲインに対して、シーケンステーブルのターゲット SIM イオンの数と元のメソッドの SIM イオンの数は一致させてください。
複数のタイムセグメントがある場合、質量オーバーライドは最初のタイムセグメントの SIM イオンにのみ適用されます。
メソッド内で同じ極性の複数のゲインで SIM イオン数が異なる場合、このメソッドの質量をオーバーライドすることはできません。メソッド内で同じ極性の複数のゲインで SIM イオン数が異なる場合、このメソッドの質量をオーバーライドすることはできません。
オーバーライド質量：101; -201
SIM イオン | ゲイン | 極性 |
SIM 1 | 0.1 | + |
SIM 2 | 0.1 | - |
SIM 3 | 1.1 | + |
SIM 4 | 1.1 | - |
SIM 5 | 2.2 | + |
SIM 6 | 2.2 | - |
ポジティブへのオーバーライド：101
ネガティブへのオーバーライド：201
SIM イオン | ゲイン | 極性 |
SIM 1 | 0.1 | + |
SIM 3 | 1.1 | + |
SIM 5 | 2.2 | + |
SIM 2 | 0.1 | - |
SIM 4 | 1.1 | - |
SIM 6 | 2.2 | - |
SIM イオン | 質量 | ゲイン | 極性 |
SIM 1 | 101 | 0.1 | + |
SIM 3 | 101 | 1.1 | + |
SIM 5 | 101 | 2.2 | + |
SIM 2 | 201 | 0.1 | - |
SIM 4 | 201 | 1.1 | - |
SIM 6 | 201 | 2.2 | - |
オーバーライド質量：101; -201, 301
SIM イオン | ゲイン | 極性 |
SIM 1 | 0.1 | + |
SIM 2 | 2.2 | - |
SIM 3 | 1.1 | - |
SIM 4 | 0.1 | + |
ポジティブへのオーバーライド：101; 301
ネガティブへのオーバーライド：201
SIM イオン | ゲイン | 極性 |
SIM 1 | 0.1 | + |
SIM 4 | 0.1 | + |
SIM 3 | 1.1 | - |
SIM 2 | 2.2 | - |
SIM イオン | 質量 | ゲイン | 極性 |
SIM 1 | 101 | 0.1 | + |
SIM 4 | 301 | 0.1 | + |
SIM 3 | 201 | 1.1 | - |
SIM 2 | 201 | 2.2 | - |
オーバーライド質量：101; -201, 301
SIM イオン | ゲイン | 極性 |
SIM 1 | 0.1 | + |
SIM 2 | 2.2 | - |
SIM 3 | 1.1 | - |
SIM 4 | 0.1 | + |
ポジティブへのオーバーライド：101
ネガティブへのオーバーライド：201
SIM イオン | ゲイン | 極性 |
SIM 1 | 0.1 | + |
SIM 4 | 0.1 | + |
SIM 3 | 1.1 | - |
SIM 2 | 2.2 | - |
オリジナルメソッドにはゲイン 0.1 のポジティブ SIM イオンが 2 個あるが、ポジティブのオーバーライド質量は 1 つしか指定してされていないため、オーバーライドは失敗します。ポジティブのオーバーライド質量を2つ指定する必要があります。
同じ極性の各ゲインごとに、質量オーバーライドの数と SIM イオンの数を一致させる必要があります。