O cálculo de pureza de pico MS se baseia na porcentagem de íons componentes dos espectros que se agrupam e constituem o alvo em relação a outros componentes presentes.
O aplicativo executa as seguintes etapas para calcular a pureza de pico MS:
Execute uma deconvolução em todo o intervalo cromatográfico.
Exibir detalhes da tarefaExibir detalhes da tarefa |
Para os valores m/z detectados (n) mais abundantes, crie um Cromatograma de Íons Extraídos (EIC). Você pode definir o número no método de processamento em Compostos > Espectros, na guia Pureza de Pico MS.
Em cada EIC, encontre o tempo de retenção do pico.
Defina os componentes baseados nos picos EIC que eluem no mesmo tempo de retenção.
Determine o componente-alvo que corresponde ao composto-alvo.
Exibir detalhes da tarefaExibir detalhes da tarefa |
Obtenha parâmetros básicos para mais cálculos:
Intervalo delta m/z, das configurações padrão internas (m/z -0,3 a +0,7)
Quantificador-alvo m/z, ao extrair o espectro MS no ápice do pico TIC e encontrar o m/z de maior abundância
Janela do tempo de retenção para o composto-alvo (composto atual), a partir do método de processamento em Compostos > Identificação
Para cada componente encontrado por deconvolução, encontre todos os valores de m/z que caem dentro do intervalo delta m/z do quantificador-alvo m/z.
Para cada valor de m/z, verifique se o EIC possui um ápice dentro da janela do tempo de retenção do pico EIC do quantificador-alvo.
Obtenha o componente com o maior pico e use-o como componente-alvo.
Se o sistema não conseguir localizar um componente-alvo, ele tentará novamente executando a deconvolução de amostra completa em modo de alta resolução, usando um fator de tamanho de janela RT que é reduzido por um fator de 2. Os resultados de alta resolução são armazenados em cache e são pesquisados quanto a qualquer componente-alvo que não possa ser encontrado na lista de componentes de resolução normal. A geração automática dos resultados de alta resolução permite que muitos componentes-alvo, que antes haviam se perdido, sejam identificados.
O sistema tenta detectar componentes duplos que compartilham o mesmo RT e o pico base m/z. A presença de tais componentes duplicados pode influenciar fortemente a estimativa de pureza pela negativa. Componentes duplicados poderão ocorrer se o fator de tamanho de janela RT for muito pequeno. Portanto, o sistema tenta recuperar automaticamente executando novamente a deconvolução de amostra completa no modo de baixa resolução, usando um fator de tamanho de janela que é aumentado por um fator de 2. Os resultados de baixa resolução são armazenados em cache e são pesquisados quanto a qualquer alvo que corresponda a um componente duplicado.
Obtenha todos os componentes contribuintes, ou seja, qualquer componente que tenha picos espectrais dentro do intervalo de delta m/z do quantificador-alvo m/z e que sobreponha o pico-alvo no tempo de retenção.
Calcule a pureza usando a seguinte fórmula: