Método de processamento: Análise Espectral: Deconvolução Espectral MS

Use a configuração do método de Deconvolução Espectral LC/MS para a Deconvolução Espectral. Os parâmetros do método de Deconvolução Espectral estão na Análise Espectral > Deconvolução Espectral MS.

Estes parâmetros são usados pelo algoritmo de deconvolução para encontrar e agrupar íons relacionados e calcular cargas e pesos moleculares. Use as configurações padrão para incluir compostos de alto e baixo peso molecular. Para amostras individuais, você pode desejar alterar algumas configurações.

Deconvolução automática

Executar deconvolução automática	Selecione esta caixa de seleção caso pretenda executar a deconvolução automaticamente durante cada processamento de dados.
Usar Janela RT	Opcional: Selecione uma janela do tempo de retenção. A deconvolução automática só será executada em espectros de picos TIC dentro do tempo determinado.
Tipo de pico TIC	Selecione qual tipo de pico a deconvolução automática deve usar de um sinal TIC SCAN: Picos identificados: Somente os picos definidos na tabela de compostos (nó de Identificação de > Compostos no método de processamento), são usados para deconvolução automática. Picos não identificados: Somente os picos que não estão listados na tabela de compostos (nó de Identificação de > Compostos no método de processamento), são usados para deconvolução automática. Todos os picos: Os picos identificados e não identificados são usados para deconvolução automática.
Limite de pico de TIC	Selecione como os picos devem ser filtrados de um sinal TIC SCAN: Nenhum: A deconvolução será executada em todos os picos do Cromatograma MS sem qualquer tipo de filtragem. (n) maiores picos: A deconvolução será executada no número determinado de maiores picos por altura do pico no cromatograma MS. Altura do pico: A deconvolução será executada em todos os picos do Cromatograma MS com uma altura do pico acima do valor determinado. Área do pico: A deconvolução será executada em todos os picos do Cromatograma MS com uma área do pico acima do valor determinado.

Adutos

Estas caixas de combinação listam íons adutos positivos e negativos comuns. O íon selecionado é usado durante a deconvolução para compensar pelo íon aduto usado para produzir os espectros de carga múltipla.

Para adicionar um aduto positivo ou negativo, insira a sua fórmula química no campo de entrada correspondente e clique em +. Para excluir um aduto da lista, clique com o botão direito nele e selecione Excluir.

Configurações básicas

Usar intervalo m/z	Selecione esta caixa de seleção caso pretenda visualizar os resultados da Deconvolução Espectral de uma determinada faixa de m/z. Selecionar a caixa de seleção habilita os campos onde define esta faixa de m/z. A janela do Espectro MS mostrará a faixa de m/z em cinza claro após executar a Deconvolução.
Baixo peso molecular	Define o peso molecular mais baixo que será reportado pela Deconvolução. O padrão é de 500 uma.
Alto peso molecular	Define o peso molecular mais alto. O padrão é de 50.000 uma.
Carga Máxima	A carga máxima não indica necessariamente um corte absoluto para as atribuições de carga. Indica apenas a carga mais alta que pode ser aplicada a um pico sendo usado para buscar picos relacionados. Por exemplo, suponha que a carga máxima seja de 30 e que essa carga tenha sido aplicada a um pico A durante a busca por picos relacionados; o pico A encontrará vizinhos relacionados com cargas de 27 a 29 e 31 a 33. Os picos com cargas de 31 a 33 não serão ignorados pelo simples fato de que a carga máxima é de 30. Contudo, um estado de carga acima de 30 não seria aplicado ao pico A durante a busca por picos relacionados. Os valores padrão para Carga Máxima (50) e Picos mínimos no conjunto (3) são definidos para que tanto os compostos de peso molecular alto quanto os de baixo sejam encontrados. Tome cuidado ao usar esses padrões se tiver um espectro com muitos picos e tiver definido o valor de Picos mínimos no conjunto para 3. Nestas condições, o algoritmo poderá facilmente encontrar componentes extras de 2 ou 3 picos. Para restringir o algoritmo, reduza a carga máxima quando os Picos mínimos no conjunto forem 3. Os componentes com apenas 2 ou 3 picos geralmente têm baixos pesos moleculares, de modo que é apropriado usar um intervalo de carga mais baixo. Por exemplo, uma carga de 30 em um pico com um valor m/z de cerca de 1500 dá um peso molecular perto de 45.000. Portanto, alterar a carga máxima para 30 é suficiente para compostos com um peso molecular de até 45.000. Se uma carga máxima mais alta for necessária para encontrar compostos de alto peso molecular, altere os Picos mínimos no conjunto para 4 ou mais. Geralmente, os compostos de alto peso molecular têm componentes com vários picos. Uma abordagem alternativa é usar o Baixo peso molecular e o Alto peso molecular para restringir o intervalo de massas que a Deconvolução irá relatar. Ao usar o Baixo peso molecular e o Alto peso molecular, também é útil definir a carga máxima a um valor adequado.
Picos mínimos no conjunto	Este parâmetro é o número mínimo de íons relacionados necessários para que os íons sejam considerados um conjunto e possam ser separados do espectro original. O número padrão e mínimo é 3. Aumentar esse valor pode ajudar a limitar os componentes encontrados para um espectro com muitos íons. Quando o número mínimo de íons é 3, há um tratamento especial dos conjuntos de íons com estados de carga +1 e +2 ou -1 e -2, +2 e +3 ou -2 e -3, +3 e +4 ou -3 e -4, apenas +1 ou -1 e apenas +2 ou -2 (somente se a largura do íon for <=0,4). São usados a equivalência do peso molecular, a existência de isótopos, o espaçamento de isótopos, as razões de isótopos e as larguras de picos para a atribuição de carga baixa.
Exibir picos não correspondentes	Se marcar esta caixa de seleção, os pontos de dados que não pertencem a um grupo de íons relacionados serão incluídos como um objeto nos resultados intermediários. Por padrão, a caixa de seleção está desmarcada, ou seja, apenas os picos correspondentes são incluídos. Observar os picos não correspondentes pode lhe fornecer uma pista sobre a presença de pequenas séries de carga múltipla não detectadas.

Configurações avançadas

Equivalência do peso molecular (0,01%)	Determina o quanto os íons deslocados pelos seus estados de carga devem corresponder entre si em peso molecular. Os valores são inseridos como números inteiros, mas são expressos como 0,01%. Assim, o intervalo é de 0 a 100 (ou seja, 0 a 1%); o padrão é de 5 (0,05%). Um valor mais baixo significa que os íons devem ter uma correspondência mais próxima em peso molecular. Um valor mais alto significa que os íons podem estar mais distantes do peso molecular médio. Um valor de zero significa que os íons devem apresentar uma correspondência exata. Um valor mais baixo diferente de zero reforça as restrições ao determinar quais componentes são válidos para os dados.
Threshold de ruído absoluto	O maior entre o Threshold de abundância relativa (%) relativo e o Threshold de ruído absoluto absoluto determina quais íons serão usados para encontrar íons relacionados para um componente. Use o Threshold de ruído absoluto para analisar sinais pequenos. O padrão é 1000. O intervalo é de 0 a 1.000.000.
Threshold de abundância relativa (%)	O valor deste parâmetro representa uma porcentagem da abundância do maior íon do espectro. Qualquer íon cuja abundância exceda o corte de abundância pode ser usado para prever outros íons em um conjunto. O padrão é de 10%. O maior entre o Threshold de abundância relativa (%) relativo e o Threshold de ruído absoluto determina quais íons serão usados para encontrar íons relacionados para um componente. O Threshold de ruído absoluto é especialmente útil para analisar sinais grandes; convém reduzi-lo para sinais pequenos. Esse valor não impede que os íons do espectro estejam em um conjunto de íons relacionados; ele impede que íons menores sejam usados para prever outros íons em um conjunto.
Algoritmo de peso molecular	Selecione o algoritmo usado para determinar o peso molecular. O padrão é Ajuste da Curva, que fornece os melhores resultados quando os conjuntos de íons são de distribuição Gaussiana ou têm resolução isotópica. O Centroide oferece uma média ponderada dos pontos de dados acima do Threshold do algoritmo de peso molecular (%).
Threshold do algoritmo de peso molecular (%)	Determina a parte do envelope de massa reconstruída resultante que será usada para encontrar o peso molecular. Esse valor representa a porcentagem da abundância mais alta do envelope. Os pontos de dados que ocorrerem acima desse threshold de abundância serão usados para determinar o peso molecular. O padrão é de 40%. Convém aumentar este parâmetro se os dados tiverem ruído ou se o pico "final" for muito assimétrico para evitar que a parte assimétrica do envelope próximo à base do envelope seja usada nos cálculos do peso molecular. Se esse valor for muito alto, somente uma pequena quantidade dos pontos de dados será usada no ajuste da curva, o que pode resultar em uma falha no ajuste da curva. Se o ajuste da curva falhar, tente usar o parâmetro do Algoritmo de peso molecular Centroide para estados de carga baixa com dados com ruído. De outra forma, tente reduzir o Threshold do algoritmo de peso molecular (%). O algoritmo começa no máximo do maior íon e desce pelo lado principal do pico do íon ao longo dos pontos de dados em direção ao corte atribuído. Se encontrar isótopos resolvidos ou não resolvidos que ultrapassem os 10% do slope descendente, o algoritmo traçará uma linha de corte a partir do ponto mais baixo antes de voltar a subir ao longo do pico do íon até um ponto na borda de fuga que se encontra diretamente oposto ao ponto mais baixo.
Threshold de envelope (%)	Determina a exatidão com que o formato de um grupo de íons deve corresponder a um formato ligeiramente gaussiano para que o algoritmo aceite o grupo como um componente. O intervalo é de 0 a 100%. Zero significa que o formato do envelope não será aplicado. Quanto maior o valor, mais rigorosa será a aplicação do formato. O valor padrão é 50, o que significa que a abundância de um íon no slope ascendente do envelope não pode estar abaixo de 50% da abundância do íon à esquerda. Também significa que a abundância de um íon no slope descendente do envelope não pode estar abaixo de 50% do íon à direita.