Agrupamento é a coleta de várias frações no mesmo recipiente de coleta. Pode-se agrupar frações de várias injeções da mesma amostra ou uma injeção de cada amostra.
As frações são agrupadas automaticamente ao especificar injeções múltiplas da mesma posição em uma linha da tabela de sequência, ou caso a mesma posição de início da fração seja especificada para posições sequenciais na tabela de sequência.