Regras para substituir os íons do SIM de uma sequência (LC/MS)

Você pode substituir os íons do SIM no método especificando as massas alvos na Tabela de Sequências. Você insere os íons do SIM a substituir na coluna SQ:Massa SIM.

Os íons do SIM que serão substituídos e como sua massa é alterada são definidos por um conjunto de regras. Você introduzirá uma sequência de massas na Tabela de Sequências usando um padrão similar a "xxx;xxx;xxx", onde "xxx" é substituído por massas. Essa entrada será validada por um conjunto separado de regras. Se a validação passar, as Substituições de Massas serão aplicadas aos íons do SIM.

  • Os íons SIM não podem ser substituídos em métodos que incluem parâmetros do sinal de gatilho da coleta de fração.

  • Os íons do SIM no método original são divididos primeiro por Polaridade. Em seguida, eles são classificados com base nos valores de Ganho.

  • Cada Substituição de Massa indica a polaridade por um número positivo (polaridade positiva) ou um número negativo (polaridade negativa).

  • As massas alvos para Substituições de Massas são números separados por um ponto e vírgula (";").

  • A entrada de Massa SIM para Substituições de Massas pode ter uma polaridade ou polaridades mistas (por exemplo, "101; - 201; 301"), que precisam corresponder às polaridades dos íons do SIM no método original.

  • O número de íons do SIM alvo na Tabela de Sequências precisa corresponder ao número de íons do SIM no método original para cada valor de Ganho na mesma Polaridade.

  • Quando você tem vários segmentos de tempo, as substituições de massas só se aplicam aos íons do SIM no primeiro segmento de tempo.

  • Se o método tiver um número diferente de íons do SIM para vários valores de Ganho para a mesma polaridade no método, esse método não suportará a substituição de massa. Por exemplo, se Ganho 1 tiver 2 íons do SIM no método, então o Ganho 2 para a mesma polaridade também deverá ter 2 íons do SIM para suportar a substituição de massa.

  • Um fragmentador em rampa não pode ser substituído por um valor fixo.

Exemplo 1 – caso simples

Entrada de substituições de massa e método original

Substituições de massa: 101; -201

Íon do SIM

Ganho

Polaridade

SIM 1

0.1

+

SIM 2

0.1

-

SIM3

1.1

+

SIM4

1.1

-

SIM5

2.2

+

SIM6

2.2

-

Divisão por polaridade

Substituições positivas: 101

Substituições negativas: 201

Íon do SIM

Ganho

Polaridade

SIM 1

0.1

+

SIM 3

1.1

+

SIM5

2.2

+

SIM2

0.1

-

SIM4

1.1

-

SIM6

2.2

-

Aplicar substituição

Íon do SIM

Massa

Ganho

Polaridade

SIM 1

101

0.1

+

SIM 3

101

1.1

+

SIM5

101

2.2

+

SIM2

201

0.1

-

SIM4

201

1.1

-

SIM6

201

2.2

-

Exemplo 2 – ganho duplicado

Entrada de substituições de massa e método original

Substituições de massa: 101; -201, 301

Íon do SIM

Ganho

Polaridade

SIM 1

0.1

+

SIM 2

2.2

-

SIM3

1.1

-

SIM4

0.1

+

Divisão por polaridade

Substituições positivas: 101; 301

Substituições negativas: 201

Íon do SIM

Ganho

Polaridade

SIM 1

0.1

+

SIM 4

0.1

+

SIM 3

1.1

-

SIM 2

2.2

-

Aplicar substituição

Íon do SIM

Massa

Ganho

Polaridade

SIM 1

101

0.1

+

SIM 4

301

0.1

+

SIM 3

201

1.1

-

SIM 2

201

2.2

-

Exemplo 3 – erro

Entrada de substituições de massa e método original

Substituições de massa: 101; -201, 301

Íon do SIM

Ganho

Polaridade

SIM 1

0.1

+

SIM 2

2.2

-

SIM3

1.1

-

SIM4

0.1

+

Divisão por polaridade

Substituições positivas: 101

Substituições negativas: 201

Íon do SIM

Ganho

Polaridade

SIM 1

0.1

+

SIM 4

0.1

+

SIM 3

1.1

-

SIM 2

2.2

-

Aplicar substituição

A substituição falha porque o método tem dois íons do SIM positivos com um ganho de 0,1, portanto, é necessário especificar duas substituições de massa.

O número de substituições de massa deve corresponder ao número de íons do SIM para cada ganho exclusivo na mesma polaridade.

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