Normalmente, o tempo de gradiente na segunda dimensão é muito mais longo para o heart cutting do que com a técnica abrangente. A desvantagem das técnicas padrão de heart cutting é que os picos não podem ser amostrados enquanto um gradiente de segunda dimensão ainda estiver correndo. Nos exemplos mostrados aqui, o gradiente da segunda dimensão está analisando o primeiro pico (roxo), enquanto o segundo e terceiro picos (cinza e amarelo) eluem da primeira coluna de dimensão. A segunda dimensão está pronta quando o 4º pico (verde) elui da primeira dimensão; este pico pode ser analisado. Como a segunda dimensão é ocupada novamente, o quinto pico (azul) não pode ser analisado.
Este problema é resolvido usando uma configuração chamada 2D-LC heart-cutting múltiplo. Aqui, os circuitos de amostragem na válvula 2D-LC são trocados com válvulas de seleção de 6 posições/14 portas, equipadas com seis loops cada. Nesta configuração, um pico pode ser cortado e armazenado, depois analisado assim que a segunda dimensão estiver livre.
Picos que são cortados e armazenados durante uma corrida são analisados consecutivamente na segunda dimensão, mesmo quando a primeira dimensão ainda estiver correndo. Para evitar a carryover, os picos são analisados em ordem inversa de armazenamento em uma única Válvula de Heart-cutting Múltiplo.
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