使用 MS 作为液相色谱检测器时，质谱将与色谱图中的每一数据点相关联。
要获得高质量且准确的质谱，必须优化 MS，以便
调谐是指调整 MS 参数以达到上述目标的过程。
LC/MS 有两组可以进行调整的参数。其中一组参数与离子的形成相关。这些参数控制雾化室和碎裂电压。另一组参数与离子的传输、过滤和检测相关。这些参数控制锥孔、八极杆、透镜、四极杆质量过滤器和 HED 电子倍增器（检测器）。
调谐主要是找到控制离子传输、过滤和检测的参数的正确设置。通过将调谐液引入到 LC/MS 并生成离子可以完成这一任务。使用这些离子时，可以调整调谐参数，从而达到灵敏度、分辨率和质量分配的目标。在一些例外情况下，将不调整控制离子形成的参数。这些参数将被设为有利于生成调谐液溶剂离子的固定值。
对于 LC/MSD iQ，不支持手动调谐。此外，不能将调谐文件保存到其他名称。
调谐的结果会生成调谐文件，其中包含两组或多组参数设置：一组是正电离，一组是负电离。软件将自动调用适合方法指定的离子极性和扫描模式的设置。自动调谐，自动调谐算法，同时还生成一个报告。调谐文件将保存在 MS 仪器中。如果在新的 PC 上启动 MS，则 MS 已经拥有自己的调谐参数。
在数据采集的过程中，与离子形成关联的参数由数据采集方法控制。与离子传输关联的参数由指定给数据采集方法的调谐文件控制。
自动调谐是一种在整个质量范围内对 LC/MS 进行调谐以获得良好性能的自动调谐算法。
还可以运行检验调谐。
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