イオンリスト

オリゴ解析では、ソフトウェアに、予測イオンと付加化合物の情報を入力しておく必要があります。オリゴのプロジェクトまたは結果セットに、CSV ファイルとして、これらの情報をアップロードします。

以下の要領で CSV ファイルを準備します。

  • CSV 区切り文字としてコンマ (,) を使用

  • 小数点としてピリオド (.) を使用

  • 各イオンに対して、以下の値を入力

    • m/z(数値)

    • Name(文字列)

    • Type (Ion または Adduct)

    • Category(文字列)。たとえば、Abasic、n-1、または n+1

      Category(分類)は、レポートで結果をグループ化するために使用されます。

  • イオンリストに、完全長生成物のナトリウム付加(m/z = FLP + 5.5)および完全長生成物のリン酸ジエステル(m/z = FLP - 4)が含まれていることを確認します。これらのイオンが含まれていない場合は、イオンリストの読み込み中にエラーが表示されます。

  • オプションの値:Degradation product(ブール値)

    Degradation product の値がイオンリストに含まれる場合、Type が Ion になっているすべてのエントリについて、この列で TRUE または FALSE を入力します。空の値は FALSE として処理されます。

    Type が Adduct の場合、情報は無視されます。

以下に例を示します。

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