Como o Data Analysis procura compostos e qualificadores MS
Ao adicionar ou atualizar compostos MS de um método de processamento MS, o aplicativo analisa os dados automaticamente da seguinte forma:
Para dados de varredura:
No cromatograma TIC em SCAN, extraia um espectro MS com subtração de linha de base para cada pico integrado.
Esses espectros MS são definidos automaticamente como espectros MS de referência na seção Compostos > Espectros do método.
Procure íons qualificadores (consulte Sobre os íons qualificadores) e liste-os no método de processamento.
Se uma biblioteca tiver sido selecionada no método, faça a pesquisa para cada espectro MS e use nomes das melhores correspondências da biblioteca como nomes do composto.
Em cada espectro MS, identifique o pico de base (íon mais abundante) como o pico do composto.
Para o valor m/z de cada pico de base, extraia um EIC e procure o pico mais próximo do pico TIC em SCAN (apenas internamente, não visível para o usuário).
O sinal TIC em SCAN é adicionado como um sinal de composto à tabela de composto. O nome do composto é a melhor correspondência da biblioteca ou é criado a partir do tempo de retenção, por exemplo, pico@1.001min. O TIC em SCAN é definido como o sinal para todos os compostos. Os sinais EIC estão disponíveis na lista suspensa.
Cada composto possui um sinal atribuído que corresponde a um TIC em SCAN.
Para SIM ou dados de Scan/SIM:
Selecione compostos diretamente a partir de alvos SIM definidos no método de aquisição.
Em cada sinal SIM, identifique o pico mais abundante.
Se os sinais SIM forem rotulados com nomes diferentes no método de aquisição, todos os sinais SIM serão adicionados à tabela de composto como compostos-alvo.
Se sinais SIM forem marcados com o mesmo nome, o mais abundante será o composto alvo. Os outros sinais serão atribuídos como qualificadores, caso atendam aos requisitos de qualificador. Os que não atendem aos requisitos de qualificador serão destacados e marcados como inválidos e o tempo de retenção permanecerá em branco.
Se os sinais SIM não estiverem marcados com um nome, o nome do composto será m/z #.
Se o Data Analysis não conseguir localizar um pico para um determinado sinal SIM, o tempo de retenção não será preenchido na tabela de composto. A linha de tabela é destacada para marcá-la como inválida. Você deve adicionar as informações ausentes manualmente antes de salvar o método de processamento.
Se um composto for especificado como ISTD, será um ISTD na tabela de compostos.