高级采集 > 采集 (LC/MS)

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编辑采集参数表

编辑高级采集部分

编辑方法

MS 全局参数

“方法编辑器”的 SQ 部分中的每个部分都包含两个窗格。“MS 全局参数”窗格是在“仪器设置”>“SQ”>“方法”部分中顶部的窗格。如果任何“仪器设置”>“SQ”>“方法”部分可见,则该窗格也可见。请参见高级采集 > MS 全局参数窗格

采集参数

在“采集参数”表的每行中设置扫描类型扫描行SIM 行有不同的列。

“采集参数”表格

下列信息显示在“采集参数”表中。单击某个列标题可按该列对表格排序。如果当前编辑的单元格导致错误,则当前编辑的单元格将显示为粉色,工具提示将显示附加信息。如果存在验证错误,则无法保存方法。

  • 时间 (min) – 开始采集 SIM 信号的时间。将在整个运行过程中收集扫描信号,因此,如果扫描类型是扫描,则该值不可用。如果在馏分收集触发信号表中指定了信号,则必须为所有 SIM 扫描段输入 0 值。

  • 扫描类型扫描SIM。行内容的变化取决于该选择。只能有四行的扫描类型是扫描。如果在馏分收集触发信号表中指定了信号,则只能有两行的扫描类型是扫描,扫描类型为 SIM 的行只能有 200 行。

  • 极性

  • 化合物/扫描段名称

  • 质量范围起始 (m/z) – 请参阅扫描范围。该值只在扫描类型扫描时可用。Pro iQ 的扫描质量范围为 2-3000,Pro iQ Plus 的扫描质量为 2-1600,步进值为 0.1。

  • 质量范围终止 (m/z) – 请参阅扫描范围。该值只在扫描类型扫描时可用。Pro iQ 的扫描质量范围为 2-3000,Pro iQ Plus 的扫描质量为 2-1600,步进值为 0.1。

  • 质量 (m/z) – 扫描类型为 SIM 时要使用的质量。该值仅在扫描类型SIM 时可用。Pro iQ 的扫描质量范围为 2-3000,Pro iQ Plus 的扫描质量为 2-1600,步进值为 0.1。

  • 四极杆分辨率 – 选择四极杆分辨率选项,以控制质量窗口和峰宽。该值只在扫描类型SIM 时可用。

    • :0.4 Da(仅可用于 Pro iQ 和 Pro iQ Plus 仪器)。最高校正到 1000 m/z。

    • 单位:0.7 Da

    • :1.2 Da

    • 最宽:2.5 Da

  • 扫描/驻留时间 (ms) – 此计算基于每秒目标点数、质量范围和 SIM %。

  • 检测器增益因子 – 请参阅检测器增益因子。如果来自用户定义的检测器增益因子的转换的 EMV 达到或超过 EMV 的最大值 (3000 V),则 EMV 将设置为最大值。

  • 碎裂电压 (V) – 请参见碎裂电压。如果值为阶升,请参见高级采集 > 阶升表

  • 碎裂电压阶升? – 是否为此次扫描使用碎裂电压阶升。如果选中,则单击 Button_OpenRampTable.jpg 查看高级采集 > 阶升表。该值只在扫描类型扫描时可用。

  • ISTD? – 此 SIM 段是否是内标。该值只在扫描类型SIM 时可用。

  • 阈值 – 用于扫描段的阈值。确定被报告前最小的信号值。通常值在 0 和 500 之间。该值只在扫描类型扫描并且数据存储棒状图时可用。

  • 离子模式 – 如果您安装了复合离子源,则为离子模式。LC/MSD iQ 上不支持 MMI 源。

“采集参数”表格工具栏

该工具栏适用于“采集参数”表中的扫描行和 SIM 行。

工具栏图标

操作

TB_RampAddRow.jpg

添加一行到表格中。

TB_InsertRowScanSegments.jpg

表格中插入一行。

TB_RampDeleteRow.jpg

从表中删除所选行。

TB_FillColumnScanSegments.jpg

将所选单元格复制到列中的所有其他单元格。

TB_CutSelectedRowScanSegments.jpg

该功能不可用。

TB_CopySelectedRowsScanSegments.jpg

从表中复制所选行/单元格。

TB_PasteRowsScanSegments.jpg

从剪贴板粘贴行/单元格。

edit.png

将所选行移至馏分收集触发信号表。

“采集参数”表格快捷菜单

右键单击此窗格中的数字参数时可使用此快捷菜单。

剪切

删除当前内容。只有在选择当前参数的内容时才能使用此命令。

复制

复制当前内容。只有在选择当前参数的内容时才能使用此命令。

粘贴

将内容从剪贴板粘贴到当前位置

每秒目标点数 (Hz)

选中时,需要在每秒目标点数 (Hz) 参数中输入您想实现的每秒点数。如果存在扫描SIM 扫描类型,则可编辑 SIM %扫描/驻留时间 (ms) 的计算基于每秒目标点数 (Hz)扫描质量范围和/或 SIM 质量和 SIM %。更改任何这些值会产生不同的扫描/驻留时间 (ms)

要获得最佳峰积分和定量,在峰上的最佳点数是 10 到 15 个。在设置每秒目标点数 (Hz) 时,考虑色谱条件所产生的峰宽。

清除每秒目标点数 (Hz) 时,可为所有扫描类型输入扫描/驻留时间 (ms) 所需的值。

每秒实际目标点数 (Hz)

选择其中一个每秒目标点数 (Hz) 的预定值。

为您提供每秒 1 至 15 个可能匹配的数据点数。计算基于点数、质量段、极性和调谐文件值。在文本框中输入每秒点数后,软件使用该值计算出最接近的每秒实际点数值,并用作每秒实际点数 (Hz) 值。最接近每秒目标点数值 (Hz)每秒实际目标点数值 (Hz) 被选用。当没有可用的每秒实际点数值时,SIM % 参数中会显示错误信息。

如果一种方法只有 SIM 扫描类型,每秒实际目标点数将只列出与用户输入的每秒目标点数值最接近的值。

每秒实际点数值的目的是让您可以选择接近您所输入的每秒目标点数的每秒点数,以准确反映仪器将实现的实际数据采集率。

估计循环时间(ms/循环)

估计循环时间和扫描速度是估计值。只有配置并连接了馏分收集器且运行 OpenLab CDS 2.8 Feature Pack 02 或更高版本时,馏分收集触发信号表才可用。如果未启用馏分收集触发信号,则会出现以下情况:MS 将按照序列和方法馏分收集触发信号表中的规定采集所有馏分收集触发信号数据。所有馏分收集触发信号的采集方式与启用 MS 信号进行馏分收集时的方式相同,并可在 Data Analysis 中查看。不会根据 MS 信号触发任何馏分,Data Analysis 中基于质量的馏分收集轨迹上也不会出现任何馏分触发开始和结束标记。UV 馏分将仅根据 UV 信号并按照 UV 信号的馏分收集设置进行触发。要根据这些 MBFC 信号触发馏分,必须在馏分收集器中启用 SQ 方法中使用的峰触发。未启用 MS 峰触发信号的数据可在数据分析和馏分预览中查看,但它们不会触发馏分收集。

用于显示计算出的可以执行一次所有活动信号的时间(以毫秒为单位)。这也可能被当作是每个设定信号中的色谱数据点之间的时间。

估计循环时间(ms/循环)会在您更改扫描起点扫描终点极性(如果方法是混合极性)或扫描/驻留时间时自动更新。

该循环时间是使用表格中的质量数量和驻留时间自动计算的。

数据存储

棒状图轮廓图。有了棒状图,您便能记录模拟数据质量的数学中心处的质荷比和丰度。记录了单个 m/z 和丰度数据点。有了轮廓图,就可以保存所有过滤的原始数据。它使用的磁盘空间比棒状图数据多(将创建较大的数据文件)。对多电荷样品或在大量使用质谱平均计算时使用轮廓图。有了轮廓图,就不会对扫描行使用阈值了。

如果方法没有任何扫描段,则数据存储参数不可用。

估计最大扫描速度 (Da/s)

您无法直接设置扫描速度;它是基于扫描范围、SIM % 和每秒实际点数等其他参数计算出来的。该值会得出质量过滤器的扫描速度。

如果选择每秒目标点数 (Hz),则当您在扫描表中更改质量范围起始、质量范围终止或添加 SIM 行时,估计最大扫描速度都会随之更新。它还会受 SIM % 值和每秒目标点数 (Hz) 值的影响。

如果清除每秒目标点数 (Hz),则该值还会受表中扫描/驻留时间 (ms) 的影响。

如果任意行的质量范围(质量范围终止 - 质量范围起始)增加,则扫描速度增加。如果您增加了扫描段数量,则扫描速度增加。

如果方法没有任何扫描段,则估计最大扫描速度 (Da/s) 参数不可用。

SIM %

用于 SIM 的每个循环的百分比。使用 SIM % 可根据工作流程调整仪器在 SIM 数据采集和扫描数据采集之间的工作循环。使用较低的 SIM % 可能会提高扫描模式的性能,这是因为离子采样得到了改善。延长扫描时间通常可以改善采样。例如,对于具有两个扫描和三个 SIM 的方法,SIM % 适合使用值 5%。

如果选择表中的每秒目标点数以及“扫描”和“SIM”类型,则可编辑此值。在编辑此值时,扫描/驻留时间 (ms) 将会更改。如果编辑 SIM % 值,可能还需要编辑每秒目标点数 (Hz) 值。

如果手动更改 SIM % 值,清除然后选择每秒目标点数 (Hz),则会记住该值。

如果方法没有任何 SIM 段,则 SIM % 参数不可用。

馏分收集触发信号

使用馏分收集触发信号表指定单离子监测 (SIM) 模式下的加合物离子作为化合物的馏分收集峰触发信号。  化合物的峰触发信号是分配给同一馏分收集器峰触发的所有 SIM 的总和。  这同时包括正极性和负极性加合物。

只有配置并连接了馏分收集器且运行 OpenLab CDS 2.8 Feature Pack 02 或更高版本时,馏分收集触发信号表才可用。如果未启用馏分收集触发信号,则会出现以下情况:MS 将按照序列和方法馏分收集触发信号表中的规定采集所有馏分收集触发信号数据。所有馏分收集触发信号的采集方式与启用 MS 信号进行馏分收集时的方式相同,并可在 Data Analysis 中查看。不会根据 MS 信号触发任何馏分,Data Analysis 中基于质量的馏分收集轨迹上也不会出现任何馏分触发开始和结束标记。UV 馏分将仅根据 UV 信号并按照 UV 信号的馏分收集设置进行触发。要根据这些 MBFC 信号触发馏分,必须在馏分收集器中启用 SQ 方法中使用的峰触发。未启用 MS 峰触发信号的数据可在数据分析和馏分预览中查看,但它们不会触发馏分收集。
如果未启用馏分收集触发信号,则会出现以下情况:MS 将按照序列和方法馏分收集触发信号表中的规定采集所有馏分收集触发信号数据。所有馏分收集触发信号的采集方式与启用 MS 信号进行馏分收集时的方式相同,并可在 Data Analysis 中查看。不会根据 MS 信号触发任何馏分,Data Analysis 中基于质量的馏分收集轨迹上也不会出现任何馏分触发开始和结束标记。UV 馏分将仅根据 UV 信号并按照 UV 信号的馏分收集设置进行触发。要根据这些 MBFC 信号触发馏分,必须在馏分收集器中启用 SQ 方法中使用的峰触发。未启用 MS 峰触发信号的数据可在数据分析和馏分预览中查看,但它们不会触发馏分收集。

馏分收集触发信号表

单击某个列标题可按该列对表格排序。如果当前编辑的单元格导致错误,则当前编辑的单元格将显示为粉色,工具提示将显示附加信息。如果存在验证错误,则无法保存方法。

下列信息显示在馏分收集触发信号表中。

化合物列

  • 化合物名称 – 化合物的名称。

  • 馏分目标质量列 – 在序列中使用的馏分目标质量方法覆盖列。序列表中指定的化合物名称、化合物分子式和单同位素质量将覆盖方法中指定的值,加合物的 m/z 将根据序列中的化合物值计算。

  • 馏分收集器峰触发 – MS 峰触发,具有用于触发化合物馏分收集的峰检测设置。峰触发在馏分收集器方法中定义并启用,您可在该方法中设置峰触发斜率、阈值和所有其他峰触发参数。

    要根据这些 MBFC 信号触发馏分,必须在馏分收集器中启用 SQ 方法中使用的峰触发。未启用 MS 峰触发信号的数据可在数据分析和馏分预览中查看,但它们不会触发馏分收集。
  • 化合物分子式 – 化合物的分子式。如果存在分子式,则其用于计算单同位素质量。如果分子式为空,则输入单同位素质量。

  • 单同位素质量 – 化合物的单同位素质量。该值基于分子式,也可输入其来代替化合物分子式。它用于计算用于每个加合物 SIM 信号的 m/z。

    在多电荷加合物的情况下,只要得出的加合物 m/z 在仪器的质量范围内,单同位素质量就可以超出 MS 的质量范围。

    表格中两个不同的行不允许出现化合物名称相同但单同位素质量不同的情况。

加合物种类列

  • 加合物种类 – 值基于编辑化合物窗口中加合物窗格中的选择。请参阅“编辑基于质量的馏分收集表”。

  • 极性 – 值基于编辑化合物窗口中加合物窗格中的选择。请参阅“编辑基于质量的馏分收集表”。

  • m/z – 值基于离子种类分子式和单同位素质量,不可编辑。

  • 四极杆分辨率 – 选择四极杆分辨率选项,以控制质量窗口和峰宽。该值只在扫描类型SIM 时可用。

    • :0.4 Da(仅可用于 Pro iQ 和 Pro iQ Plus 仪器)。最高校正到 1000 m/z。

    • 单位:0.7 Da

    • :1.2 Da

    • 最宽:2.5 Da

  • 驻留时间 (ms) – 此计算基于每秒目标点数、质量范围和 SIM %。如果“采集参数”窗格中未启用每秒目标点数,则该值可编辑。

  • 检测器增益因子 – 请参阅检测器增益因子。如果来自用户定义的检测器增益因子的转换的 EMV 达到或超过 EMV 的最大值 (3000 V),则 EMV 将设置为最大值。

  • 碎裂电压 (V) – 请参见碎裂电压。如果值为阶升,请参见高级采集 > 阶升表。对于用作馏分收集触发信号参数的 SIM 信号,无法对碎裂电压值进行阶升。

馏分收集触发信号表格工具栏

工具栏图标

操作

expand.png

展开表中的所有化合物。

collapse.png

折叠表中的所有化合物。

fill.png

对于可编辑列,使用与选定单元格中相同的值填充列中的所有单元格。

cut.png

从表格中剪切选定的行或化合物并将其添加到剪贴板。

copy.png

为选定的化合物行复制化合物中的所有加合物。对于复制的每个加合物,化合物信息都会附加到每个加合物行的开头。

paste.png

从剪贴板粘贴剪切或复制的行或化合物。

选择一个化合物行会复制化合物中的所有加合物,采用每个加合物一行的形式,化合物和加合物都有相应的列。将复制单个选定的加合物行,且每个选定的加合物都包含相应的化合物信息。

move.png

将所选行移至采集参数表。

add.png

打开“添加化合物”对话框。

edit.png

打开“编辑化合物”对话框。

另请参见

高级采集 > MS 全局参数窗格

高级采集 > 离子源

高级采集 > 色谱图

高级采集 > 时间表

编辑采集参数表 (LC/MS)

在编辑馏分收集触发信号表中添加或编辑化合物 (LC/MS)