OpenLab CDS용 Oligo Analysis Accelerator(OAA)는 합성 올리오뉴클레오티드의 순도 및 함량 확인을 위한 데이터 분석을 간소화하는 소프트웨어 애드온입니다. Agilent LC/MSD 단일 사중극자 검출기로 획득한 native 데이터에서 일반적으로는 번거롭고 많은 노력이 드는 단계를, 단계별로 안내해 주는 마법사(wizard)가 쉽게 수행할 수 있도록 도와줍니다.
Oligo 분석을 시작하기 전에 우선 OpenLab CDS 프로젝트 및 프로세싱 방법을 준비해야 합니다.
OAA 웹 인터페이스에 액세스하려면 애드온이 설치된 클라이언트에서 https://localhost:52088/openlab/oaa/login을 여십시오. 그 다음, 소프트웨어 마법사(wizard)가 관련된 단계들을 순차적으로 안내해 줍니다.
애플리케이션 노트는 https://www.agilent.com/cs/library/applications/an-openlab-oligo-analysis-accelerator-5994-7993en-agilent.pdf에서 확인할 수 있습니다.
전체 워크플로에는 다음 단계가 포함되어 있습니다.
네거티브 체크아웃을 수행합니다.
수집에서 수집 방법을 준비합니다.
수집에서 시퀀스를 설정합니다.
데이터를 수집합니다.
데이터 분석에서 결과 세트 및 프로세싱 방법을 준비합니다.
OAA 웹 인터페이스에서 OAA 프로젝트 파라미터를 설정합니다.
OAA 웹 인터페이스에서 Oligo 분석을 실행합니다.
Oligo 분석에는 다음 단계가 포함되어 있습니다.
초기 설정: 프로젝트 설정을 결과 세트에 적용합니다. 시스템 적합성(System Suitability) 및 시료에 대한 데이터 분석 방법 파라미터를 완료하고 이것 또한 적용합니다.
시스템 적합성(System Suitability): QC 표준물질에 대한 UV 적분을 확인하고 필요한 경우 조정합니다. UV와 MS의 검량 곡선이 생성되고 MS 결과가 요약됩니다. 각 SST 파라미터에 대한 통과/실패 결과를 확인합니다. 결과가 요약 페이지에 보고됩니다.
이온 분류: 임계값을 초과하는 이온은 자동으로 알려짐, 알 수 없음 또는 첨가 생성물로 분류됩니다. 추가 조사가 필요한 경우 표준과 가혹 MS 소스 모두의 스펙트럼을 사용할 수 있습니다. 분류를 확인하고 필요한 경우 조정합니다. 추출 전에 최종 분류된 이온 목록이 보고됩니다.
적분: 분류된 이온 목록의 추출 이온 크로마토그램이 적분됩니다. 또한 각 시료에 대한 UV 시료도 적분됩니다. 필요한 경우 EIC 및 UV 적분을 조정합니다.
요약: 순도 및 함량 계산의 요약을 점검하고 확인합니다.
데이터 분석에서 결과를 보고합니다. 필요에 따라 전자 서명 및 승인을 적용합니다.
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